Hola
Primero es saber por que le han salido las manchas que dices,quizas el lavado no lo arregle
Con la planta tan pequeña no te recomiendo un lavado de raices
Si esta en una maceta pequeña,ponla en una mayor y se arregla sola
Si la maceta es grande,o sea la definitiva,un lavado de raices eliminara muchos nutrientes de la tierra,y tendras que empezar a abonar muy pronto
Las raices no se pudren por echarles mucha agua,se pudren al tener mucha agua constantemente,si dejas la tierra secar entre riego y riego,no pasara nada
Cuando regamos es bueno que salga agua por abajo de la maceta,asi no se acumulan tantas sales y no son nesesarios apenas los lavados de raices
Suerte