Yo lo que haría sería quitar las partes afectadas con botrytis. Apagaría el ventilador de dentro del indoor, apagaría la intracción y la extracción, me pondría unos guantes de látex e iría quitando las partes afectadas con todo el cuidado de no tocar las partes que no tienen bortytis. Si lo haces sin apagar el ventilador es más probable que caigan esporas y se esparzan por todo el armario.
Una vez quitado todo lo afectado revisaría los cogollos. Ya sé que no mola toquetearlos, pero en casos así vale la pena tener cogollos abiertos y toqueteados antes de que se te pase algo de botrytis y te acabe jodiendo el cultivo.
Después de haber revisado los cogollos echaría el botriprot que te comentan (o cualquier otro fungicida contra botrytis con plazo de seguridad inferior a 12 días) y nada más echarlo encendería la intracción y la extracción a tope para conseguir que se sequen las plantas lo antes posible. Incluso para cubrirme las espaldas, en 2 o 3 días echaría botriprot de nuevo y que el día del corte haga los 10 días del plazo de seguridad.